L'homme de 35 ans aurait tué les deux animaux après son forfait.
Le procureur a présenté les deux carcasses des chèvres comme preuve devant une cour de Kangundo, à l'est de la capitale Nairobi.
L'homme a déclaré avoir été torturé et battu par la police.
Le magistrat a demandé qu'il soit transporté à l'hôpital pour traitement après ses accusations contre la police.
L'affaire avait été mise en délibéré le 29 janvier dernier selon BBC.
La justice kényane prévoit une peine de prison de 14 ans pour toute personne coupable d'actes sexuels avec un animal.
Un homme accusé d'avoir «fait l'amour» à des chèvres
Un Kényan a été accusé d'avoir eu des relations sexuelles avec deux chèvres appartenant à ses voisins.